Mgr. Vojtěch Kasalický, Ph.D.
Postdoktorand
Oddělení mikrobiální ekologie vody
Hydrobiologický ústav
+420 38777 5887; +420 608 38 07 28
vojtech.kasalicky@hbu.cas.cz
104A
Zajímá mě ekologie nepatogenních sladkovodních bakterií, jejich mikrodiversita, ko-existence s ostatními mikroorganismy a faktory vysvětlující jejich výskyt a život ve vodě. Zkoumám rod Limnohabitans (Betaproteobacteria), který se vyskytuje pravidelně v jezerech, přehradách a rybnících. Během doktorského studia se mi podařilo vyizolovat více než 50 kmenů Limnohabitans z různých habitatů. V současnosti řeším regulaci fotosyntézy u jednotlivých kmenů, která se zdá být daleko více regulovaná než u purpurových bakterií. Dále se věnuji studiu jejich metabolických vlastností porovnáváním genomů z vybraných kmenů. ResearcherID: AAC-2903-2021 or F-8578-2014 Scopus Author ID: 13408103000 Loop profile: 846891 ORCID: 0000-0002-9132-8321 Vzdělání:
2006 to 2012: Ph.D. studium obor Hydrobiologie, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích. [Dizertační práce: Ecophysiological characteristics of key members of Betaproteobacteria in freshwater bacterioplankton]. Školitel: Karel Šimek
2003 – 2006: Mgr. (= MSc.) obor Fyziologie rostlin. Biologická fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích. [Diplomová práce: "Daily rhythms of photosynthetic activity of diatom Thalassiosira weissflogii: impact of natural light-regime and nitrogen limitation“]. Školitel: Ondřej Prášil
2000 – 2003: Bc. obor Biologie, Biologická fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích.
Odborná praxe:
od července 2012: postdok, Hydrobiologický ústav, Biologické Centrum AVČR v.v.i.
2006 – 2012: Ph.D. studium, Hydrobiologický ústav, Biologické Centrum AVČR v.v.i.
2004 – 2006: MSc. studium, Laboratoř fotosyntézy, Mikrobiologický ústav AVČR v.v.i., pracoviště v Třeboni
Zahraniční pobyty a praxe:
2004 – 2010: Laboratoire Océanographique de Villefranche sur mer, France; Dr. Markus Weinbauer and Dr. Antoine Sciandra (dohromady 3 měsíce)
2007 – 2012: Institut für Limnologie OAW, Austria; Dr. Martin Hahn (několik krátkodobých pobytů)
2011: Universität Konstanz, Germany; Dr. Heike Freese (dva týdny)
2013: Leibniz Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries, IGB, Germany; Hans-Peter Grossart, Dr. PD (5 měsíců)
Účast na projektech:
GAČR 17-04828S (2017 – 2019) (PI – Rohit Ghai) Objasnění životních strategií sladkovodních virů pomoci metagenomiky. Člen vědeckého týmu.
GAČR 15-12197S (2015 – 2017) (PI – Vojtěch Kasalický) Factors regulating the phototrophic activity of freshwater community of Betaproteobacteria.
GAČR 15-12197S (2015 – 2017) (PI – Petr Porcal) The effect of solar light on key members of freshwater Betaproteobacteria. Člen vědeckého týmu.
GAČR 13-00243S (2013 – 2017) (PI – Karel Šimek) Unveiling life strategies of selected groups of planktonic Betaproteobacteria in relationship to carbon flow to higher trophic levels. Člen vědeckého týmu.
MŠMT/EE CZ.1.07/2.3.00/30.0032 – (2012-2015) (PI – František Sehnal) Promotion of research [Vytvoření postdoktorandských pozic na Biologickém centru AV ČR k rozvoji biologických disciplín a dosažení globální konkurenceschopnosti.] Postdoc. Člen vědeckého týmu.
GAČR GAP504/10/0566 (2010 – 2012) (PI – Jan Jezbera) "Distribution, phylogeography and within-taxon ecological differentiation of Limnohabitans cluster and Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus." Člen vědeckého týmu.
GAČR GA206/08/0015 (2008 – 2012) (PI – Karel Šimek) "Ecophysiological traits and grazing- and virus-induced mortality of bacterial strains representing major bacterioplankton groups in a reservoir". Člen vědeckého týmu.
|
Celkem nalezeno: 29 záznamů
|
|---|
|
Henriques Vieira H.,
Bulzu P., Kasalický V.,
Haber M.,
Znachor P., Piwosz K.,
Ghai R. (2024) Isolation of a widespread giant virus implicated in cryptophyte bloom collapse. The ISME Journal
18: wrae029.
DOI: 10.1093/ismejo/wrae029 |
|
Park H.,
Bulzu P.,
Shabarova T.,
Kavagutti V.,
Ghai R., Kasalický V.,
Jezberová J. (2024) Uncovering the genomic basis of symbiotic interactions and niche adaptations in freshwater picocyanobacteria. Microbiome
12: 150.
DOI: 10.1186/s40168-024-01867-0 |
|
Kavagutti V.,
Bulzu P.,
Chiriac M.,
Salcher M.,
Mukherjee I.,
Shabarova T.,
Grujčić V.,
Mehrshad M., Kasalický V., Andrei A.S.,
Jezberová J.,
Seďa J.,
Rychtecký P.,
Znachor P.,
Šimek K.,
Ghai R. (2023) High‑resolution metagenomic reconstruction of the freshwater spring bloom. Microbiome
11: 15.
DOI: 10.1186/s40168-022-01451-4 |
|
Park H.,
Shabarova T.,
Salcher M.,
Kosová L.,
Rychtecký P.,
Mukherjee I.,
Šimek K.,
Porcal P.,
Seďa J.,
Znachor P., Kasalický V. (2023) In the right place, at the right time: the integration of bacteria into the Plankton Ecology Group model. Microbiome
11: 112.
DOI: 10.1186/s40168-023-01522-0 |
|
Hejzlar J.,
Blabolil P.,
Čtvrtlíková M.,
Jůza T., Kasalický V.,
Kubečka J.,
Seďa J.,
Znachor P. (2022) Účinnost biomanipulace pro řízení vodního ekosystému a kvality vody ve vodárenských nádržích? [Biomanipulation efficiency for the control of aquatic ecosystem and water quality in water supply reservoirs?] Proc. Conf. Water Supply Biology 2022
147-156.
|
|
Šimek K.,
Grujčić V.,
Mukherjee I., Kasalický V.,
Nedoma J., Posch T.,
Mehrshad M.,
Salcher M. (2020) Cascading effects in freshwater microbial food webs by predatory Cercozoa, Katablepharidacea and ciliates feeding on aplastidic bacterivorous cryptophytes FEMS Microbiology Ecology
96: fiaa121.
DOI: doi.org/10.1093/femsec/fiaa121 |
|
Grujčić V., Nuy J. K.,
Salcher M.,
Shabarova T., Kasalický V., Boenigk J., Jensen M. ,
Šimek K. (2018) Cryptophyta as major bacterivores in freshwater summer plankton ISME Journal
12: 1668-1681.
DOI: 10.1038/s41396-018-0057-5 |
|
Kasalický V., Zeng Y. H. , Piwosz K.,
Šimek K.,
Kratochvilová H., Koblížek M. (2018) Aerobic Anoxygenic Photosynthesis Is Commonly Present within the Genus Limnohabitans Applied and Environmental Microbiology
84: e02116-17.
DOI: 10.1128/AEM.02116-17 |
|
Nguyen N.H.A., Špánek R., Kasalický V., Ribas D., Vlková D., Řeháková H., Kejzlar P., Ševců A. (2018) Different effects of nano-scale and micro-scale zero-valent iron particles on planktonic microorganisms from natural reservoir water Environmental Science: Nano
5: 1117.
DOI: 10.1039/c7en01120b |
|
Šimek K.,
Grujčić V., Hahn M., Horňák K.,
Jezberová J., Kasalický V.,
Nedoma J.,
Salcher M.,
Shabarova T. (2018) Bacterial prey food characteristics modulate community growth response of freshwater bacterivorous flagellates Limnology and Oceanography
63: 484–502.
DOI: 10.1002/lno.10759 |
|
Horňák K., Kasalický V.,
Šimek K., Grossart H. (2017) Strain-specific consumption and transformation of alga-derived dissolved organic matter by members of the Limnohabitans-C and Polynucleobacter-B clusters of Betaproteobacteria Environmental Microbiology
19: 4519-4535.
DOI: 10.1111/1462-2920.13900 |
|
Horňák K., Kasalický V.,
Šimek K., Grossart H. (2017) Strain-specific consumption and transformation of alga-derived dissolved organic matter by members of the Limnohabitans-C and Polynucleobacter-B clusters of Betaproteobacteria Environmental Microbiology
19: 4519–4535 .
DOI: 10.1111/1462-2920.13900 |
|
Jezberová J.,
Jezbera J.,
Znachor P.,
Nedoma J., Kasalický V.,
Šimek K. (2017) The Limnohabitans genus harbors generalistic and opportunistic subtypes: evidence from spatiotemporal succession in a canyon-shaped reservoir Applied and Environmental Microbiology
83: e01530-17.
DOI: 10.1128/AEM.01530-17 |
|
Jezberová J.,
Jezbera J.,
Znachor P.,
Nedoma J., Kasalický V.,
Šimek K. (2017) The Limnohabitans genus harbors generalistic and opportunistic subtypes: evidence from spatiotemporal succession in a canyon-shaped reservoir Applied and Environmental Microbiology
83: e01530-17.
DOI: 10.1128/AEM.01530-17 |
|
Shabarova T., Kasalický V.,
Šimek K.,
Nedoma J.,
Znachor P., Posch T., Pernthaler J.,
Salcher M. (2017) Distribution and ecological preferences of the freshwater lineage LimA (genus Limnohabitans) revealed by a new double hybridization approach Environmental Microbiology
19: 1296–1309 .
DOI: 10.1111/1462-2920.13663 |
|
Peerakietkhajorn S., Kato Y. , Kasalický V., Matsuura T., Watanabe H. (2016) Betaproteobacteria Limnohabitans strains increase fecundity in the crustacean Daphnia magna: symbiotic relationship between major bacterioplankton and zooplankton in freshwater ecosystem. Environmental Microbiology
18: 2366–2374..
DOI: 10.1111/1462-2920.12919 |
|
Salcher M., Ewert C.,
Šimek K., Kasalický V., Posch T. (2016) Interspecific competition and protistan grazing affect the coexistence of freshwater betaproteobacterial strains. FEMS Microbiology Ecology
92: -.
DOI: 10.1093/femsec/fiv156 |
|
Grujčić V., Kasalický V.,
Šimek K. (2015) Prey-specific growth responses of freshwater flagellate communities induced by morphologicallly distinct bacteria from the genus Limnohabitans. Applied and Environmental Microbiology
81: 4993–5002 .
DOI: 10.1128/AEM.00396-15 |
|
Šimek K.,
Nedoma J.,
Znachor P., Kasalický V.,
Jezbera J., Horňák K.,
Seďa J. (2014) A finely tuned symphony of factors modulates the microbial food web of a freshwater reservoir in spring. Limnology and Oceanography
59: 1477–1492..
|
|
Jezbera J.,
Jezberová J., Kasalický V.,
Šimek K., Hahn M. (2013) Patterns of Limnohabitans microdiversity across a large set of freshwater habitats as revealed by reverse line blot hybridization. PLOS ONE
8: e58527..
DOI: DOI: 10.1371/journal.pone.0058527 |
