Jihočeští vědci objevili pět nových virů

Tisková zpráva, 22. 2. 2016, České Budějovice

„Pokud chceme s viry bojovat, potřebujeme vědět, jak virus funguje a kde jsou jeho slabá místa. Nebo pro příklad, virus, napadající mikroskopické houby, které zase napadají škodlivý hmyz, je schopen zesílit nebo zmenšit intenzitu toho, jak je houba agresivní vůči hmyzu. To znamená, když poznáme virus a to, jak funguje, můžeme ho použít v biotechnologiích v boji proti škůdcům,“ říká vedoucí oddělení virologie rostlin Igor Koloniuk, jeden z kolektivu autorů objevu.

Zatímco klasickým sekvenováním bylo možné “přečíst” jen předem vybrané, krátké kousky dědičné informace, technologie NGS dovede najednou zobrazit veškerou dědičnou informaci obsaženou v daném zkoumaném vzorku. Jak vysvětluje virolog Ondřej Lenz z Biologického centra AV ČR, není to ale zas tak jednoduché, protože získaná informace je rozstříhaná na menší kousíčky o cca 100 – 150 písmenkách, a ty je nejprve potřeba správně složit. „Vlastně nejprve rozstříháte Shakespearův román, do toho několik dalších knih, přimícháte stejně rozstříhané kratší povídky, okořeníte krátkými vtipy, vše důkladně promícháte, a pak se snažíte všechno zase správně poskládat. Sestavení kompletní dědičné informace virů, která se podobá těm rozstříhaným povídkám, tak může připomínat ono pověstné hledání jehly v kupce sena,“ popisuje Ondřej Lenz.

Když se ale zadaří, je možné odhalit nejen známé viry, ale i ty, které se množí bez zjevných příznaků virové infekce, či viry, které dosud nebyly popsány vůbec. To se stalo i v tomto případě.  Nově objevené viry se množí v rybízu, třešních a mikroskopických houbách, a ukazují, že virový svět je mnohem rozmanitější, než jsme si doposud mysleli.