Výzkum

Repetitivní DNA sekvence a jejich vliv na organizaci a evoluci rostlinného genomu

• Analýza složení a výskytu transponovatelných elementů a satelitních opakování v rostlinném genomu
• "Next-generation" sekvenování, bioinformatická analýza sekvenačních dat
• Zkoumání molekulárních mechanizmů vedoucích k amplifikaci, homogenizaci a eliminaci repetitivních sekvencí z rostlinného genomu

Vývoj nových bioinformatických postupů pro analýzu sekvencí získaných pomocí "next-generation" sekvenování

• Vývoj software pro de novo identifikaci a charakterizaci repetitivních elementů z "shotgun" sekvencí získaných "next-generation" sekvenováním
• Komplexní charakterizace repetic v jednom druhu
• Srovnávací analýza celkové kompozice repetic v různých genomech
• Analýza satelitní DNA

Struktura a evoluce centromer u luštěnin

• Výzkum složení centromerických repetic v chromozómech luštěnin (P.sativum, Vicia sp.)