Struktura

Ředitel: Prof. RNDr. Jan Kubečka, CSc.

Administrativa a technické služby (ATS)

Oddělení mikrobiální ekologie vody (MEV)

Vedoucí: Prof. RNDr. Karel Šimek, CSc.

Oddělení ekologie ryb a zooplanktonu (ERZ)

Vedoucí: RNDr. Jiří Peterka, PhD.

Oddělení hydrochemie a ekosystémového modelování (HEM)

Vedoucí: Doc. Ing. Josef Hejzlar, CSc.

Vědecká rada

Předseda: RNDr. Petr Znachor, Ph.D.